La Institución Educativa San José Obrero se ha consolidado como una gran Institución, donde se han fortalecido especialmente los procesos de Convivencia y se ha venido desarrollando procesos para organizar todo lo relacionado con sus procesos académicos, 2006 el Instituto Colombiano de Normas Técnicas ICONTEC realiza las auditorias de otorgamiento emite concepto favorable para la Certificación es así como la institución se constituye en uno de los nueve (9) Colegios, del sector Oficial, en ser los primeros CERTIFICADOS bajo la Norma ISO9001:2000 en Sistema de Gestión de Calidad hasta la actualidad.